Футбольный клуб «Атырау» участвует в турнирах команд мастеров с 1980 года. Первое название команды — «Прикаспиец». Созданная в те времена команда участвовала в чемпионате
, 1981 год). Затем футбольная команда в Атырау была закрыта.
Возрождение клуба пришлось на 2000 год. Образованный клуб назывался «Ак Жайык» и изначально принимал участие в турнире среди команд Первой лиги. Уже на следующий год команда, сменив название на «Атырау», приняла участие в турнире высшего дивизиона. Цвета возрожденного клуба были выбраны, как — зелёный и белый. В первом же сезоне команда под руководством известного казахстанского специалиста Ваита Талгаева сумела добиться высокого результата, а именно — занять второе место в турнирной таблице чемпионата. Лучшим бомбардиром в том сезоне в составе «Атырау» стал — нападающийГурам Макаев, на его счету 17 забитых мячей.
В следующем сезоне команда Талгаева повторила этот успех. На этот раз лучшим бомбардиром с 11 забитыми голами стал Виталий Кицак. В сезоне 2003 года результаты «нефтяников» ухудшились — команда заняла лишь 4-е место. Триумф на поля Атырау вернулся в 2009 году, когда команда в первый раз в своей истории выиграла Кубок Казахстана. В финальной встрече на стадионе «Астана Арена» «Атырау» обыграл карагандинский «Шахтёр» со счетом — 1:0. Единственный забитый мяч на счету российского нападающего Дениса Зубко. Возглавлял эту команду казахстанский специалист Еркош Сакурович.