Резервная команда «Кремня» выступала преимущественно в турнирах местного уровня, в 2000 году став серебряным призёром чемпионата Полтавской области[1]. В 1999 году резервисты кременчужан впервые приняли участие в любительском чемпионате Украины, однако стали последними в своей группе, одержав одну победу в 10 матчах[2]. В сезоне 2019/20 молодёжная команда клуба, под названием «Кремень-Юниор», снова участвовала в чемпионате Украины среди любителей, однако снова стала последней в турнирной таблице своей группы[3].
Современная команда была создана в 2021 году и была заявлена для участия в чемпионате Полтавской области[4]. Уже спустя год «Кремень-2» был включён в состав участников второй лиги чемпионата Украины. Дебютную игру на профессиональном уровне резервисты «Кремня» провели 5 сентября 2022 года, на выезде уступив николаевскому «Васту» со счётом 5:0[5]