Лигазы
Лигаза (
фермент, катализирующий соединение двух молекул с образованием новой химической связи — лигирование. При этом обычно происходит отщепление (гидролиз
) небольшой химической группы от одной из молекул.
Лигазы относятся к классу ферментов EC 6.
В молекулярной биологии лигазы подкласса 6.5 классифицируют на РНК-лигазы и ДНК-лигазы.
Классификация
- КФ 6.1 включает лигазы, образующие связи между кислородом и углеродом
- КФ 6.2 включает лигазы, образующие связи между серой и углеродом
- КФ 6.3 включает лигазы, образующие связи между азотом и углеродом
- КФ 6.4 включает лигазы, образующие связи между углеродом и углеродом
- КФ 6.5 включает лигазы, образующие фосфодиэфирные связи
- КФ 6.6 включает лигазы, образующие связи между азотом и металлами
ДНК-лигазы
ДНК
ДНК-лигазы —
АТФ
.
Один из самых распространённых коммерчески доступных ферментов — ДНК-лигаза бактериофага Т4.
ДНК-лигазы млекопитающих
У млекопитающих классифицируют три основных типа ДНК-лигаз.
- ДНК-лигаза I лигирует фрагменты Оказаки в ходе репликации отстающей цепи ДНК и участвует в эксцизионной репарации[1].
- ДНК-лигаза III в комплексе с белком XRCC1 участвует в эксцизионной репарации и в рекомбинации.
- ДНК-лигаза IV в комплексе с иммуноглобулинов.
Ранее выделяли ещё один тип лигаз - ДНК-лигазу II, которая позднее была признана артефактом выделения белков, а именно продуктом протеолиза ДНК-лигазы III[2].
Примечания
- ↑ Mortusewicz, O., Rothbauer, U., Cardoso, M. C., Leonhardt, H. Differential recruitment of DNA Ligase I and III to DNA repair sites. Nucleic acids research, 2006; 34(12), 3523-32. PMID 16855289
- ↑ Tomkinson, A. E., & Mackey, Z. B. Structure and function of mammalian DNA ligases. Mutation Research/DNA Repair; 1998; 407(1), 1-9. PMID 9539976
.svg){kind=small} | Это заготовка статьи по биохимии. Помогите Википедии, дополнив её. |
| Активность | |
|---|---|
| Регуляция | |
| Классификация | |
| Типы |
|
| Инициация |
| ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Элонгация |
| ||||||
| Терминация | |||||||