XbaI
XbaI | |
---|---|
Идентификаторы | |
Шифр КФ | 3.1.21.4 |
Базы ферментов | |
IntEnz | IntEnz view |
BRENDA | BRENDA entry |
ExPASy | NiceZyme view |
MetaCyc | metabolic pathway |
KEGG | KEGG entry |
PRIAM | profile |
PDB structures | RCSB PDB PDBe PDBj PDBsum |
Поиск | |
PMC | статьи |
PubMed | статьи |
NCBI | NCBI proteins |
XbaI - эндонуклеаза рестрикции, выделенна из бактерии Xanthomonas badrii [1].
Свойства
XbaI относится к эндонуклеазам рестрикции (Тип II, подтип P). То есть XbaI распознает палиндромную последовательность ДНК и осуществляет рестрикцию внутри палиндрома в фиксированной точке. В присутствии диметилсульфоксида (ДМСО) и при высоких концентрациях глицерина в среде XbaI теряет способность распознавать палиндром и осуществляет неспецифическую рестрикцию (звёздная активность) [источник не указан 2343 дня]. После рестрикции образуются липкие концы с выступами из четырёх оснований.
Палиндромный участок | Продукты рестрикции |
---|---|
5'-TCTAGA-3' 3'-AGATCT-5' |
5'-T CTAGA-3' 3'-AGATC T-5' |
XbaI рестриктазная активность ингибируется при метилировании аденина (DAM метилаза). Однако, рестриктазная активность сохраняется при метилировании цитозина (DCM- или CpG-метилазы) [источник не указан 2343 дня].
После завершения рестрикции ДНК, XbaI может быть инактивирована денатурацией нагреванием до 65°C в течение 20 минут [источник не указан 2343 дня].
Применение
XbaI широко используется в молекулярно-биологических исследованиях. В частность XbaI применяется при клонировании специфических нуклеотидных последовательностей [2], при рестрикционном анализе.
Так например, XbaI использовалась при анализе полиморфизма рецептора эстрогена α[3] и липопротеина а (ApoB)[4].
Ссылки
- ↑ Biolabs, New England XbaI | NEB . www.neb.com. Дата обращения: 8 мая 2016. Архивировано 3 февраля 2022 года.
- ↑ Principles and techniques of biochemistry and molecular biology. — 7th ed. — Cambridge, UK: Cambridge University Press, 2010. — xvi, 744 pages с. — ISBN 9780521516358.
- 12 января 2018 года.
- 12 января 2018 года.