Pandoravirus (лат.) — родвирусов из монотипного семейства Pandoraviridae. Включает 6 видов. Один из крупнейших известных вирусов (на момент открытия — самый крупный).
семейства Mimiviridae[англ.], поражающих амёбAcantamoeba[англ.]. Как и мимивирусы, они были выделены из образцов, которые демонстрировали сильную литическую активность при совместном выращивании с культурами[англ.]Acanthamoeba. Первый вид нового рода, Pandoravirus salinus, был выделен из образца неглубоких донных отложений из побережья центрального Чили, а второй вид, Pandoravirus dulcis, был изолирован из грязи, собранной со дна пресного пруда рядом с Мельбурном (Австралия). Геномы обоих вирусов были секвенированы при их выделении. Ещё один вирус, имеющий морфологию Pandoravirus, Pandoravirus inopinatum, был выделен в 2008 году у пациента, страдавшего от кератита, вызванного Acanthamoeba. Только спустя шесть лет из-за большого размера удалось установить его вирусную природу. В 2015 году его геном был секвенирован[6]. В 2018 году описано ещё три вида: Pandoravirus macleodensis найден в образцах пресного водоёма рядом с Мельбурном, всего в 700 м от того места, где найден P. dulcis; Pandoravirus neocaledonia изолирован в солоноватой воде мангровых зарослей возле аэропорта Нумеа (Новая Каледония) и Pandoravirus quercus, найденный в грунте Марселя (Франция). Тогда же принято решение выделить род в отдельное семейство. Результат филогенетического исследования рода, проведённого при описании этих трёх видов, можно проиллюстрировать следующей кладограммой[3]
:
Pandoravirus
P. inopinatum
P. quercus
P. salinus
P. dulcis
P. macleodensis
P. neocaledonia
Структура
Pandoravirus можно рассмотреть в
пищеварительной вакуоли. В отличие от мимивируса, у пандоравирусов нет электронно-плотной центральной области, которая соответствует компактизированному геному[6]
.
Геном
Геном пандоравирусов представлен линейной двуцепочечной
белки, кодируемые геномом P. salinus, имеют размер от 26 до 2367 аминокислотных остатков (а. о.), средняя длина составляет 258 а. о.[5][8] У трёх видов, описанных в 2018 году — P. neocaledonia, P. macleodensis и P. quercus — геном также представлен линейной двуцепочечной молекулой ДНК, включающей от 1,84 до 2 млн пар оснований. Кроме того, как и у ранее известных видов рода Pandoravirus, их геномы также имеют очень высокий GC-состав — около 60 %[3]
.
Жизненный цикл
фагов, у которых сначала образуется капсид, а потом он наполняется необходимым содержимым, у пандоравирусов оба процесса идут одновременно. Любопытно, что образование капсида начинается с той верхушки, которая несёт апикальную пору. Репликационный цикл завершается, когда клетка амёбы лизируется и высвобождает наружу сотню вирусных частиц[5]
.
Примечания
↑Таксон не признан Международным комитетом по таксономии вирусов (ICTV).